Характер микробиоты толстой кишки у молодых лиц г. Архангельска

Изучение биоразнообразия микробиоты толстой кишки у жителей Арктических регионов представляет сегодня особый интерес. Сочетание культуральных и молекулярно-генетических методик позволяет полноценно оценить спектр микробиоты. Цель исследования – оценить характер микробиоты толстой кишки у молодых здоровых жителей г. Архангельска. Исследованы фекалии здоровых жителей г. Архангельска (n = 43). Анализ характера микробиоты проводили культуральным методом и полимеразной цепной реакцией (ПЦР) с определением 33 показателей. По данным ПЦР у 100 % обследуемых отмечали дефицит лактобактерий, Roseburia inulinivorans – 20,9 %, Blautia spp. – 72,1 %, Agathobacter rectalis – 37,2 %, E. coli – 60,46 %, а также избыток Fusobacterium nucleatum – в 16,28 % случаев, Streptococcus spp. – 13,95 %, Acinetobacter spp. – 6,97 %, условнопатогенных представителей порядка Enterobacteriales – в 32,58 %. По результатам культурального метода исследования регистрировали дефицит лактобактерий в 97,67 % случаев, энтерококков – 51,16 %, бактероидов – 27,91 %, типичной (лактоза+) Е. coli – 72,09 %, бифидобактерий – 13,95 %, а также выявление избытка Klebsiella spp. – в 32,58 %, Staphylococcus aureus – 4,65 %. Среднее количество лактобактерии, зарегистрированных культуральным методом составило 4,81 lg КОЕ/г, энтерококков – 5,0 lg КОЕ/г, S. aureus – 5,12 lg КОЕ/г, К. Pneumonia – 4,75 lg КОЕ/г, К. oxytoca – 5,62 lg КОЕ/г, Е. coli – 6,52 lg КОЕ/г, Bifidobacterium spp. – 9,0 lg КОЕ/г, Васteroides spp. – 9,0 lg КОЕ/г. Статистически значимые различия в определении микроорганизмов были обнаружены в отношении Lactobacillus spp., Enterococcus spp., Bifidobacterium spp., Bacteroides spp. (p < 0,001). Таким образом, культуральным и молекулярно-генетическим методами исследования нами выявлен дисбаланс микробиоты толстой кишки у здоровых жителей г. Архангельска.

1. Beam A., Clinger E., Hao L. Effect of Diet and Dietary Components on the Composition of the Gut Microbiota // Nutrients. 2021. Vol. 13 (8). P. 2795. dot: 10.3390/nul3082795.

2. Сафина Д. Д., Абдулхаков С. P., Амиров H. Б. Микробиота кишечника и ее значение для здоровья человека // Вестник современной клинической медицины. 2021. Т. 14. вып. 5. С. 81-94. doi: 10.20969/VSKM.2021.14(5)81-94.

3. Ling Z., Liu X., Cheng Y., Yan X., Wu S. Gut microbiota and aging // Critical Reviews in Food Science and Nutrition. 2022. Vol. 62 (13). P. 3509-3534. dot: 10.1080/10408398.2020.1867054.

4. Lange K., Buerger M., Slallinach A., Bams T. Effects of Antibiotics on Gut Microbiota // Digestive Disease. 2016:34(3):260-268. doi: 10.1159/000443360.

5. Campaniello D. Corbo M. R., Sinigaglia M. et al. How Diet and Phy sical Activ ity Modulate Gut Microbiota: Evidence, and Perspectives // Nutrients 2022. Vol. 14(12) P. 2456. doi: 10.3390/nu14122456.

6. van dcr Mcavc M. Gut microbiomc changes induced by a diet rich in fruits and vegetables // International Journal of Food Sciences and Nutation. 2021. Vol. 72 (5). P. 665-669. doi: 10.1080/09637486.2020.1852537.

7. Rahayu E. S., Utami T., Mariyatun M. et al. Gut microbiota profile in healthy Indonesians // World Journal of Gastroenterology. 2019. Vol. 25 (12). P. 1478-1491. doi: 10.3748/wjg.v25.i12.1478.

8. Шантырь И. И., Родионов Г. Г., Санников М. В., Светкина Е. В., Колобов Е. А. Оценка микробиоты кишечника у оперативного состава МЧС России, работающего в Арктической зоне России // Медико-биологические и социально-психологические проблемы безопасности в чрезвычайных ситуациях. 2022. Т. 2. С. 72-81. doi: 10.25016/2541-7487-2022-0-2-72-81.

9. Саликова С. П., Власов А. А., Гринсвич В. Б. Адаптация человека к условиям Крайнего Севера: фокус на коррекцию микробно-тканевого комплекса желудочно-кишечного тракта // Экология человека. 2021. Т. 28. № 2. С. 4-12. doi: 10.33396/1728-0869-2021-2-4-12.

10. Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника: отраслевой стандарт ОСТ 91500.11.0004-2003. URL: https://docs.cntdni/documenl/1200119089.

11. Иванов В. П., Бойцов А. Г., Коваленко А. Д., Ластовка О. Н., Нилова Е. Л. Совершенствование методов диагностики дисбактериозa толстого кишечника. Санкт-Петербург: Центр Госсанэпиднадзора. 2002. 31 с.

12. Определитель бактерий Берджи / пер. с англ. Г. А. Заварзина; под ред. Дж. Хоулта. Н. Крига, П. Снита. Д. Стейли. С. Уильямс. Москва: Мир, 1997. 1232 с.

13. Унгуряну Т. Н., Гржибовский А. М. Корреляционный анализе использованием пакета статистических программ STATA // Экология человека. 2014. Т. 21. № 9. С. 60-64. doi: 10.17816/humecol7210.

14. Recliarla N., Gccsala R., Shi X. Z. Gut Microbial Metabolite Butyrate and Its Therapeutic Role in Inflammatory Bowel Disease: A Literature Review // Nutrients. 2023. Vol. 15 (10). P. 2275. doi: 10.3390/nu15102275.

15. Bcrtani L., Ribaldonc D. G., Bellini M., Mumolo M. G., Costa F. Inflammatory Bowel Diseases: Is There a Role Гог Nutritional Suggestions? // Nutrients. 2021. Vol 13 (4). P. 1387. doi: 10.3390/nu13041387.

16. Tamanai-Shacoori Z., Smida L., Bousarghin L. et al. Roscburia spp.: a marker of health? // Future Microbiology. 2017. Vol. 12. P. 157-170. doi: 10.2217/finb-2016-0130.

17. Шейбак В. M., Николаева И. В., Павлкжовсц А. Ю. Микробиоценоз толстого кишечника и содержание свободных аминокислот в микробно-тканевом комплексе крыс // Вестник Витебского государственного медицинского университета. 2014. № 3. С. 50-58.

18. Li К., Нао Z., Du J., Gao Y., Yang S., Zhou Y. Bacteroides thetaiotaomicron relieves colon inflammation by activating aryl hydrocarbon receptor and modulating CD4+T cell homeostasis // International Collaboration. 2021, Vol. 90. P. 107183. doi: 10.1016/j.intimp.2020.107183.

19. Konig R. S., Albrich W. C., Kahlert C. R. et al. The Gut Microbionte in Mvalgic Encephalomyelitis (ME)/Chronic Fatigue Syndrome (CFS) |publislicd correction appears in Front Immunol. 2022 Mar 30; 13:878196] // Frontiers in Immunology. 2022. Vol. 12. P. 628741. doi: 10.3389/fimmu.2021.628741.

20. Lv M., Zhang J., Deng J. et al. Analysis of the relationship between the gut microbiota entcrotypcs and colorectal adenoma // Frontiers in Microbiology. 2023. Vol. 14. P. 1097892. doi: 10.3389/fmicb.2023.1097892.

21. Tap J., Storsnid S., Le Neve B. et al. Diet and gut microbiome interactions of relevance for symptoms in irritable bowel syndrome // Microbiome. 2021. Vol. 9 (1). P. 74. doi: 10.1186/s40168-021-01018-9.

22. Allen-Vercoe E., Strauss J., Cliadce K. Fusobacteriutn nucleatum: an emerging gut pathogen? // Gut Microbes. 2011. Vol. 2 (5). P. 294-298. doi: 10.4161/gmic.2.5.18603.

23. Hughes R. L., Holscher H. D. Fueling Gut Microbes: A Review of the Interaction between Diet. Exercise, and the Gut Microbiota in Athletes // Advances in Nutrition. 2021. Vol 12 (6). P. 2190-2215. doi: 10.1093/advances/nmab077.

24. Kim W., Whitman W. B. Metlianogens // Encyclopedia of Food Microbiology. Elsevier. 2014. P. 602-606. doi: 10.1016/B978-0-12-385112-3.00003-2.

25. Miller T. L., Wolin M. J. Methanosphaera stadtmaniae gen. now. sp. nov.: a species that forms tnetliane by reducing methanol with hydrogen // Archives of Microbiology. 1985. Vol. 141 (2). P. 116-122. doi: 10.1007/BF00423270.

26. Чеботарь И. В., Лазарева А. В., Масалов Я. К., Михайлович В. М., Маянский Н. A. Acinetobacter: микробиологические, патогенетические и резистентные свойства // Вестник Российской академии медицинских наук. 2014. Т. 69. № 9-10. С. 39-50. doi: 10.15690Arainn.v69i9-10.1130.

27. Derrien М., Vaughan Е. Е., Plugge С. М., de Vos W. М. Akkennansia muciniphila gen. now, sp. nov., a human intestinal mucin-degrading bacterium // International Journal of Systematic and Evolutionaiy Microbiology. 2004. Vol. 54. part 5. P. 1469-1476. dot: 10.1099/ijs.0.02873-0.

28. Jian C., Silvestre M. P., Middleton D. et al. Gut microbiota predicts body fat change following a low-energv diet: a preview intervention study // Genome Medicine. 2022. Vol. 14 (1). P. 54. doi: 10.1186/sl3073-022-01053-7.

29. Nam Y. D., Jung M. J., Roll S. W., Kim M. S., Bae J. W. Comparative analysis of Korean human gut microbiota by barcodcd pyroscqucncing // PLoSOnc. 2011. Vol. 6 (7). P. e22109. doi: 10.1371/journal.pone.0022109.

30. Nishijima S., Suda W., Oshiina K. et al. The gut microbiome of healthy Japanese and its microbial and functional uniqueness // DNA Research. 2016. Vol. 23 (2). P. 125-133. doi: 10.1093/dnarcs/dsvv002.

31. Kao С. C., Hsu J. W., Dwarkanatli P. et al. Indian women of childbearing age do not metabolically conserv e arginine as do American and Jamaican women // Journal of Nutrition. 2015. Vol. 145 (5). P. 884-892. doi: 10.3945/jn.114.208231.

32. Bonder M. J., Tigchclaar E. F., Cai X. et al The influence of a short-term gluten-free diet on the human gut microbiome // Genome Medicine. 2016. Vol. 8 (1). P 45. doi: 10.1186/s13073-016-0295-y.

33. Zliang J., Guo Z., Xue Z. et al. A pliylo-functional core of gut microbiota in healthy young Cliinese coliorts across lifesty les, geography and ethnicities // International Society for Microbial Ecology Journal. 2015. Vol. 9 (9). P. 1979-1990. doi: 10.1038/ismej.2015.11.

34. Маркова Ю. M., Полянина А. С., Минаева Л. П., Шевелева С. А. Апробация нового способа подготовки образцов для детекции попу ляций кишечной микробиоты методом полимерной цепной реакции // Вопросы питания. 2018. № 5. С. 34-35. doi: 10.24411/0042-8833-2018-10117.

35. Suzuki Т. A., Worobev М. Geographical v ariation of human gut microbial composition // Biology Letters. 2014. Vol. 10 (2). P. 20131037. doi: 10.1098/rsbl.2013.1037.