astmedАстраханский медицинский журналAstrakhan medical journal1992-6499ФГБОУ ВО Астраханский ГМУ Минздрава России10.17021/2019.14.3.71.79astmed-37Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL INVESTIGATIONSРАЗРАБОТКА И АПРОБАЦИЯ ТЕСТ-СИСТЕМ ДЛЯ РАННЕГО ВЫЯВЛЕНИЯ ДНК БАКТЕРИЙ BURKHOLDERIA CEPACIA COMPLEX В МОКРОТЕ МЕТОДОМ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ ПРИ МУКОВИСЦИДОЗЕDEVELOPMENT AND TESTING TEST SYSTEMS FOR THE EARLY DETECTION OF BURKHOLDERIA CEPACIA COMPLEX DNA IN SPUTUM BY POLYMERASE CHAIN REACTION IN CYSTIC FIBROSISКондратенкоО. В.KondratenkoO. V.helga1983@yandex.ruВикторовД. А.ViktorovD. A.viktorov_da@mail.ruТороповскийА. Н.ToropovskiyA. N.director@testgen.ruНазароваЮ. В.NazarovaY. V.nazarova@testgen.ruЖестковА. В.ZhestkovA. V.zhestkovav2015@yandex.ruСергиенкоД. Ф.SergienkoD. F.gazken@rambler.ruКрасовскийС. А.KrasovskiyS. A.sa_krasovsky@mail.ruФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава РоссииРоссияSamara State Medical UniversityRussian FederationООО «ТестГен»РоссияTestGene LLCRussian FederationФГБОУ ВО «Астраханский государственный медицинский университет» Минздрава РоссииРоссияAstrakhan State Medical UniversityRussian FederationФГБУ «Научно-исследовательский институт пульмонологии Федерального медико-биологического агентства»; ФГБНУ «Медико-генетический научный центр им. акад. Н.П. Бочкова»РоссияResearch Institute of Pulmonology; Medico-Genetic Scientific Center named after academician N. P. BochkovRussian Federation2019270220231437179Copyright © Кондратенко О.В., Викторов Д.А., Тороповский А.Н., Назарова Ю.В., Жестков А.В., Сергиенко Д.Ф., Красовский С.А., 20232023Кондратенко О.В., Викторов Д.А., Тороповский А.Н., Назарова Ю.В., Жестков А.В., Сергиенко Д.Ф., Красовский С.А.Kondratenko O.V., Viktorov D.A., Toropovskiy A.N., Nazarova Y.V., Zhestkov A.V., Sergienko D.F., Krasovskiy S.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.astmedj.ru/jour/article/view/37

Бактерии Burkholderia cepacia complex являются наиболее прогностически неблагоприятными патогенами при муковисцидозе. Штаммы характеризуются выраженной трансмиссивностью и способностью к распространению среди пациентов. Раннее выявление указанных бактерий является необходимым условием эрадикации и профилактики распространения в условиях стационара. Исследование мокроты методом полимеразной цепной реакции входит в перечень обследования пациентов с муковисцидозом в Европе, но пока не применяется в рутинной практике в России. Проведена разработка и апробация двух тест-систем для раннего выявления ДНК Burkholderia cepacia complex в мокроте методом полимеразной цепной реакции. Полученные результаты позволяют говорить о возможности внедрения указанных исследований в рутинную практику лабораторий центров муковисцидоза в Российской Федерации.

Burkholderia cepacia complex bacteria are the most prognostically adverse pathogens in cystic fibrosis. Strains are characterized by pronounced transmissibility and ability to spread among patients. Early detection of these bacteria is a necessary condition for eradication and prevention of spread in a hospital. The study of sputum by polymerase chain reaction is included in the list of examinations of patients with cystic fibrosis in Europe, but is not used in routine practice in Russia yet. Development and approbation of 2 test systems for early detection of Burkholderia cepacia complex DNA in sputum by polymerase chain reaction was carried out. The results allow to speak of implementing these studies in the routine practice of laboratories of cystic fibrosis centers in the Russian Federation.

муковисцидозполимеразная цепная реакцияпрофилактикаBurkholderia cepacia complexcystic fibrosisBurkholderia cepacia complexpolymerase chain reactionpreventionReferencesАфанасьева, М. В. Выживаемость взрослых больных муковисцидозом с хронической инфекцией респираторного тракта, обусловленного микроорганизмами Burkholderia cepacia complex / М. В. Афанасьева, Е. Л. Амелина, А. В. Черняк, И. Н. Бутюгина, О. Ю. Грачева, И. А. Шагинян, С. В. Поликарпова, М. Ю. Чернуха, Л. Р. Аветисян, Е. И. Кондратьева, А. В. Аверьянов, С. А. Красовский // Практическая пульмонология. - 2018. - № 1. - С. 60-64.Афанасьева, М. В. Выживаемость взрослых больных муковисцидозом с хронической инфекцией респираторного тракта, обусловленного микроорганизмами Burkholderia cepacia complex / М. В. Афанасьева, Е. Л. Амелина, А. В. Черняк, И. Н. Бутюгина, О. Ю. Грачева, И. А. Шагинян, С. В. Поликарпова, М. Ю. Чернуха, Л. Р. Аветисян, Е. И. Кондратьева, А. В. Аверьянов, С. А. Красовский // Практическая пульмонология. - 2018. - № 1. - С. 60-64.Воронина, О. Л. Характеристика генотипов штаммов Burkholderia cepacia complex, выделенных от больных в стационарах Российской Федерации / О. Л. Воронина, М. Ю. Чернуха, И. А. Шагинян, М. С. Кунда, Л. Р. Аветисян, А. А. Орлова, В. Г. Лунин, Л. В. Авакян, Н. И. Капранов, Е. Л. Амелина, А. Г. Чучалин, А. Л. Гинцбург // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2013. - № 2. - С. 22-30.Воронина, О. Л. Характеристика генотипов штаммов Burkholderia cepacia complex, выделенных от больных в стационарах Российской Федерации / О. Л. Воронина, М. Ю. Чернуха, И. А. Шагинян, М. С. Кунда, Л. Р. Аветисян, А. А. Орлова, В. Г. Лунин, Л. В. Авакян, Н. И. Капранов, Е. Л. Амелина, А. Г. Чучалин, А. Л. Гинцбург // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2013. - № 2. - С. 22-30.Красовский, С. А. Динамика показателей национального регистра больных муковисцидозом за 2011-2017 года / С. А. Красовский, Е. Л. Амелина, Н. Ю. Каширская, А. Ю. Воронкова, О. Г. Зоненко // Сибирское медицинское обозрение. - 2019. - № 2. - С. 14-18.Красовский, С. А. Динамика показателей национального регистра больных муковисцидозом за 2011-2017 года / С. А. Красовский, Е. Л. Амелина, Н. Ю. Каширская, А. Ю. Воронкова, О. Г. Зоненко // Сибирское медицинское обозрение. - 2019. - № 2. - С. 14-18.Красовский, С. А. Инфицирование респираторного тракта микроорганизмами B. cepacia complex как неблагоприятный прогностический фактор у больных муковисцидозом / С. А. Красовский, М. В. Афанасьева, Е. Л. Амелина, А. В. Черняк, И. А. Шагинян, С. В. Поликарпова, Л. Р. Аветисян, М. Ю. Чернуха, О. Г. Зоненко, И. Н. Бутюгина // Сибирское медицинское обозрение. - 2019. - № 2. - С. 89-94.Красовский, С. А. Инфицирование респираторного тракта микроорганизмами B. cepacia complex как неблагоприятный прогностический фактор у больных муковисцидозом / С. А. Красовский, М. В. Афанасьева, Е. Л. Амелина, А. В. Черняк, И. А. Шагинян, С. В. Поликарпова, Л. Р. Аветисян, М. Ю. Чернуха, О. Г. Зоненко, И. Н. Бутюгина // Сибирское медицинское обозрение. - 2019. - № 2. - С. 89-94.Baldwin, A. Multilocus sequence typing scheme that provides both species and strain differentiation for the Burkholderia cepacia complex / A. Baldwin, E. Mahenthiralingam, K. M. Thickett, D. Honeybourne, M. C. Maiden., J. R. Govan, D. P. Speert, J. J. LiPuma, P. Vandamme, C. G. Dowson // J. Clin. Microbiol. - 2005. - Vol. 43, № 9. - P. 4665-4673.Baldwin, A. Multilocus sequence typing scheme that provides both species and strain differentiation for the Burkholderia cepacia complex / A. Baldwin, E. Mahenthiralingam, K. M. Thickett, D. Honeybourne, M. C. Maiden., J. R. Govan, D. P. Speert, J. J. LiPuma, P. Vandamme, C. G. Dowson // J. Clin. Microbiol. - 2005. - Vol. 43, № 9. - P. 4665-4673.Cystic Fibrosis Foundation. Cystic Fibrosis Foundation Patient Registry : 2017 annual data report. Bethesda, MD: Cystic Fibrosis Foundation; 2018. - Режим доступа : https:// www.cff.org/Research/Researcher-Resources/Patient-Registry/2017-Patient-Registry-Annual-Data-Report.pdf, свободный. - Заглавие с экрана. - Яз. англ. - Дата обращения : 23.09.2019.Cystic Fibrosis Foundation. Cystic Fibrosis Foundation Patient Registry : 2017 annual data report. Bethesda, MD: Cystic Fibrosis Foundation; 2018. - Режим доступа : https:// www.cff.org/Research/Researcher-Resources/Patient-Registry/2017-Patient-Registry-Annual-Data-Report.pdf, свободный. - Заглавие с экрана. - Яз. англ. - Дата обращения : 23.09.2019.Dedecova, K. Novel diagnostic PCR assay for Burkholderia cenocepacia epidemic strain ST 32 and its utility in monitoring infection in cystic fibrosis patients / K. Dedecova, L. Kalferova, H. Strnad, J. Vavrova, P. Drevinek // J. Cyst. Fibros. - 2013. - Vol. 12, № 5. - P. 475-481.Dedecova, K. Novel diagnostic PCR assay for Burkholderia cenocepacia epidemic strain ST 32 and its utility in monitoring infection in cystic fibrosis patients / K. Dedecova, L. Kalferova, H. Strnad, J. Vavrova, P. Drevinek // J. Cyst. Fibros. - 2013. - Vol. 12, № 5. - P. 475-481.Dedekova, K. PCR detection of Burkholderia cepacia complex as one of key factors to handle a long-term outback / K. Dedekova, L. Fila, V. Skaliska, J. Bartosova, T. Kucerova, V. Vavrova, D. Zemkova, L. Kalferstova, O. Melter, O. Cinek, P. Drevinek // J. Cyst. Fibros. - 2012. - Vol. 11, № 5. - P. 440-445.Dedekova, K. PCR detection of Burkholderia cepacia complex as one of key factors to handle a long-term outback / K. Dedekova, L. Fila, V. Skaliska, J. Bartosova, T. Kucerova, V. Vavrova, D. Zemkova, L. Kalferstova, O. Melter, O. Cinek, P. Drevinek // J. Cyst. Fibros. - 2012. - Vol. 11, № 5. - P. 440-445.Dedekova, K. A novel diagnostic PCR for identification of highly transmissible Burkholderia cenocepacia ST32 infection / K. Dedekova, L. Kalferstova, J. Vavrova, P. Drevinek // J. Cyst. Fibros. - 2012. - Vol. 11. - P. S85. doi: 10.1016/S1569-1993(12)60283-5.Dedekova, K. A novel diagnostic PCR for identification of highly transmissible Burkholderia cenocepacia ST32 infection / K. Dedekova, L. Kalferstova, J. Vavrova, P. Drevinek // J. Cyst. Fibros. - 2012. - Vol. 11. - P. S85. doi: 10.1016/S1569-1993(12)60283-5.Dedekova, K. The role of PCR in early diagnosis and monitoring of infection with Burkholderia cepacia complex / K. Dedekova, O. Cinek, O. Melter, P. Drevinek // J. Cyst. Fibros. - 2010. - Vol. 9. - P. S27. doi: 10.1016/S1569-1993(10)60104-X.Dedekova, K. The role of PCR in early diagnosis and monitoring of infection with Burkholderia cepacia complex / K. Dedekova, O. Cinek, O. Melter, P. Drevinek // J. Cyst. Fibros. - 2010. - Vol. 9. - P. S27. doi: 10.1016/S1569-1993(10)60104-X.Drevinek, P. Widespread clone of Burkholderia cenocepacia in cystic fibrosis patients in the Czech Republic / P. Drevinek, S. Vosahlikova, O. Cinek, V. Vavrova, J. Bartosova, P. Pohunek, E. Mahenthiralingam // J. Med. Microbiol. - 2005. - Vol. 54, Pt. 7. - P. 655-659.Drevinek, P. Widespread clone of Burkholderia cenocepacia in cystic fibrosis patients in the Czech Republic / P. Drevinek, S. Vosahlikova, O. Cinek, V. Vavrova, J. Bartosova, P. Pohunek, E. Mahenthiralingam // J. Med. Microbiol. - 2005. - Vol. 54, Pt. 7. - P. 655-659.Drevinek, P. Burkholderia cenocepacia in cystic fibrosis : epidemiology and molecular mechanisms of virulence / P. Drevenik, E. Mahenthiralingam // Clin. Microbiol. Infect. - 2010. - Vol. 16, № 7. - P. 821-830.Drevinek, P. Burkholderia cenocepacia in cystic fibrosis : epidemiology and molecular mechanisms of virulence / P. Drevenik, E. Mahenthiralingam // Clin. Microbiol. Infect. - 2010. - Vol. 16, № 7. - P. 821-830.Drevinek, P. Direct PCR detection of Burkholderia cepacia complex and identification of its genomovars by using sputum as source of DNA / P. Drevinek, H. Hrbackova, O. Cinek, J. Bartosova, O. Nyc, A. Nemec // J. Clin. Mibrobiol. - 2002. - Vol. 40. - P. 3485-3488.Drevinek, P. Direct PCR detection of Burkholderia cepacia complex and identification of its genomovars by using sputum as source of DNA / P. Drevinek, H. Hrbackova, O. Cinek, J. Bartosova, O. Nyc, A. Nemec // J. Clin. Mibrobiol. - 2002. - Vol. 40. - P. 3485-3488.Govan, J. R. Evolving epidemiology of Pseudomonas aeruginosa and the Burkholderia cepacia complex in cystic fibrosis lung infection / J. R. Govan, A. R. Brown, A. M. Jones // Future Microbiol. - 2007. - Vol. 2. - P. 153-164.Govan, J. R. Evolving epidemiology of Pseudomonas aeruginosa and the Burkholderia cepacia complex in cystic fibrosis lung infection / J. R. Govan, A. R. Brown, A. M. Jones // Future Microbiol. - 2007. - Vol. 2. - P. 153-164.Isles, A. Pseudomonas cepacia infection in cystic fibrosis : an emerging problem / A. Isles, I. Maclusky, M. Corey, R. Gold, C. Prober, P. Fleming, H. Levison // J. Pediatr. - 1984. - Vol. 104. - P. 206-210.Isles, A. Pseudomonas cepacia infection in cystic fibrosis : an emerging problem / A. Isles, I. Maclusky, M. Corey, R. Gold, C. Prober, P. Fleming, H. Levison // J. Pediatr. - 1984. - Vol. 104. - P. 206-210.LiPuma, J. J. The Changing Microbial Epidemiology in Cystic Fibrosis / J. J. LiPuma // Clin. Microbiol. Rev. - 2010. - Vol. 23, № 2. - P. 299-323.LiPuma, J. J. The Changing Microbial Epidemiology in Cystic Fibrosis / J. J. LiPuma // Clin. Microbiol. Rev. - 2010. - Vol. 23, № 2. - P. 299-323.Mahenthiralingam, E. Epidemiology of Burkholderia cepacia infection in patients with cystic fibrosis: analysis by randomly amplified polymorphic DNA fingerprinting / E. Mahenthiralingam, M. E. Campell, D. A. Henry, D. P. Speert // J. Clin. Microbiol. - 1996. - Vol. 34. - P. 2914-2920.Mahenthiralingam, E. Epidemiology of Burkholderia cepacia infection in patients with cystic fibrosis: analysis by randomly amplified polymorphic DNA fingerprinting / E. Mahenthiralingam, M. E. Campell, D. A. Henry, D. P. Speert // J. Clin. Microbiol. - 1996. - Vol. 34. - P. 2914-2920.Speert, D. P. Epidemiology of Burkholderia cepacia complex in patients with cystic fibrosis / D. P. Speert, D. Henry, P. Vandamme, M. Corey, E. Mahenthiralingam // Canada Emerg. Infect. Dis. - 2002. - Vol. 8. - P. 181-187.Speert, D. P. Epidemiology of Burkholderia cepacia complex in patients with cystic fibrosis / D. P. Speert, D. Henry, P. Vandamme, M. Corey, E. Mahenthiralingam // Canada Emerg. Infect. Dis. - 2002. - Vol. 8. - P. 181-187.Sun, L. The emergence of a highly transmissible lineage of cbl+ Pseudomonas (Burkholderia) cepacia causing CF center epidemics in North America and Britain / L. Sun, R. Z. Jiang, S. Steinbach, A. Holmes, C. Campanelli, J. Forstnet, U. Sajjan, Y. Tan, M. Riley, R. Goldstein // Nat. Med. - 1995. - Vol. 1. - P. 661-666.Sun, L. The emergence of a highly transmissible lineage of cbl+ Pseudomonas (Burkholderia) cepacia causing CF center epidemics in North America and Britain / L. Sun, R. Z. Jiang, S. Steinbach, A. Holmes, C. Campanelli, J. Forstnet, U. Sajjan, Y. Tan, M. Riley, R. Goldstein // Nat. Med. - 1995. - Vol. 1. - P. 661-666.UK Registry Annual Data Report 2008. Bromley, UK: Cystic Fibrosis Trust, 2009.UK Registry Annual Data Report 2008. Bromley, UK: Cystic Fibrosis Trust, 2009.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.