<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">astmed</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Астраханский медицинский журнал</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Astrakhan medical journal</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">1992-6499</issn><publisher><publisher-name>ФГБОУ ВО Астраханский ГМУ Минздрава России</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.48612/agmu/2022.17.4.85.92</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">astmed-192</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL INVESTIGATIONS</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ MYCOBACTERIUM ABSCESSUS COMPLEX У ПАЦИЕНТОВ С МУКОВИСЦИДОЗОМ В РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>PREVALENCE OF MYCOBACTERIUM ABSCESSUS COMPLEX IN PATIENTS WITH CYSTIC FIBROSIS IN THE RUSSIAN FEDERATION</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Исматуллин</surname><given-names>Д. Д.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Ismatullin</surname><given-names>D. D.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Данир Дамирович Исматуллин, ассистент кафедры общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии </p><p>Самара</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Danir D. Ismatullin, Assistant of Department </p><p>Samara</p></bio><email xlink:type="simple">danirhalitov@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>Самарский государственный медицинский университет</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Samara State Medical University</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2022</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>09</day><month>03</month><year>2023</year></pub-date><volume>17</volume><issue>4</issue><fpage>85</fpage><lpage>92</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Исматуллин Д.Д., 2023</copyright-statement><copyright-year>2023</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Исматуллин Д.Д.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Ismatullin D.D.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.astmedj.ru/jour/article/view/192">https://www.astmedj.ru/jour/article/view/192</self-uri><abstract><p>Нетуберкулезные микобактерии – группа микроорганизмов, участвующих в развитии микобактериозов различной локализации. Пациенты с муковисцидозом имеют высокие риски инфицирования данными бактериями. Во многих странах мира отмечена высокая распространенность нетуберкулезных микобактерий у пациентов с муковисцидозом, которая варьирует от 5 до 20 %. Согласно данным, представленным в Регистре больных муковисцидозом Российской Федерации, за 2019 г. доля инфицированных нетуберкулезными микобактериями составила всего 1,0 %. В работе представлены данные анализа распространенности нетуберкулезных микобактерий в клиническом материале от пациентов с муковисцидозом из 58 регионов России. Цель: проанализировать распространенность нетуберкулезных микобактерий в клиническом материале от пациентов с муковисцидозом и изучить структуру сопутствующей флоры в образцах клинического материала. Материалы и методы. В период с 2017 по 2020 г. были выполнены микробиологические исследования 5 547 образцов клинического материала, собранного от 1 148 пациентов с муковисцидозом. Первичный посев образцов выполняли в соответствии с методиками, предложенными руководством по микробиологической диагностике инфекций дыхательных путей у пациентов с муковисцидозом. Для видовой идентификации микроорганизмов использовали метод матрично-активированной лазерной десорбции/ионизации времяпролетной масс-спектрометрии. Результаты. За анализируемый период было выделено 56 штаммов Mycobacterium abscessus complex от 21 пациента с муковисцидозом. Было идентифицировано 223 штамма микроорганизмов, выделенных от пациентов совместно с Mycobacterium abscessus complex. Большинство из них являются клинически значимыми и принимают участие в развитии инфекционного процесса. Заключение. По результатам исследования доля пациентов, от которых были выделены Mycobacterium abscessus complex, составила 1,8 %. Внедрение алгоритмов по подбору оптимальных питательных сред и сроков культивирования, возможно, повысит вероятность обнаружения нетуберкулезных микобактерий. В дальнейшем это позволит корректировать назначения антимикробной терапии и снизить вероятность развития осложнений, вызванных нетуберкулезными микобактериями, у пациентов этой группы.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>нетуберкулезные микобактерии</kwd><kwd>муковисцидоз</kwd><kwd>распространенность</kwd><kwd>структура</kwd><kwd>Mycobacterium abscessus complex</kwd><kwd>сопутствующая микрофлора</kwd><kwd>MALDI ToF масс-спектрометрия</kwd><kwd>порядок Actinomycetales</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>non-tuberculous mycobacteria</kwd><kwd>cystic fibrosis</kwd><kwd>prevalence</kwd><kwd>structure</kwd><kwd>Mycobacterium abscessus complex</kwd><kwd>accompanying microflora</kwd><kwd>MALDI ToF mass spectrometry</kwd><kwd>order Actinomycetales</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="ru">Авторы декларируют отсутствие внешнего финансирования для проведения исследования и публикации статьи</funding-statement><funding-statement xml:lang="en">The authors declare that there is no external funding for the exploration and analysis work.</funding-statement></funding-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Delghandi M. R., El-Matbouli M., Menanteau-Ledouble S. Mycobacteriosis and Infections with Non-tuberculous Mycobacteria in Aquatic Organisms : A Review // Microorganisms. 2020. Vol. 8, no. 9. P. 1368.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Delghandi M. R., El-Matbouli M., Menanteau-Ledouble S. Mycobacteriosis and Infections with Non-tuberculous Mycobacteria in Aquatic Organisms: A Review. Microorganisms. 2020; 8(9): 1368.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Thornton C. S., Mellett M., Jarand J., Barss L., Field S. K., Fisher D. A. The respiratory microbiome and nontuberculous mycobacteria : an emerging concern in human health // European Respiratory Review. 2021. Vol. 30, no. 160. P. 200299.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Thornton C. S., Mellett M., Jarand J., Barss L., Field S. K., Fisher D. A. The respiratory microbiome and nontuberculous mycobacteria: an emerging concern in human health // European Respiratory Review. 2021; 30 (160): 200299.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Gupta R. S., Lo B., Son J. Phylogenomics and Comparative Genomic Studies Robustly Support Division of the Genus Mycobacterium Into an Emended Genus Mycobacterium and Four Novel Genera // Frontiers in microbiology. 2018. Vol. 9. P. 1–41.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Gupta R. S., Lo B., Son J. Phylogenomics and Comparative Genomic Studies Robustly Support Division of the Genus Mycobacterium Into an Emended Genus Mycobacterium and Four Novel Genera. Frontiers in Microbiology. 2018; 9: 1–41.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Tzou C. L., Dirac M. A., Becker A. L., Beck N. K., Weigel K. M., Meschke J. S., Cangelosi G. A. Association between Mycobacterium avium Complex Pulmonary Disease and Mycobacteria in Home Water and Soil // Annals of the American Thoracic Society. 2020. Vol. 17, no. 1. P. 57–62.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Tzou C. L., Dirac M. A., Becker A. L., Beck N. K., Weigel K. M., Meschke J. S., Cangelosi G.A. Association between Mycobacterium avium Complex Pulmonary Disease and Mycobacteria in Home Water and Soil. Annals of the American Thoracic Society. 2020; 17 (1): 57–62.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Gebert M. J., Delgado-Baquerizo M., Oliverio A. M., Webster T. M., Nichols L. M., Honda J. R., Chan E. D., Adjemian J., Dunn R. R., Fierer N. Ecological Analyses of Mycobacteria in Showerhead Biofilms and Their Relevance to Human Health // mBio. 2018. Vol. 9, no. 5. P. e01614– e01618.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Gebert M. J., Delgado-Baquerizo M., Oliverio A. M., Webster T. M., Nichols L. M., Honda J. R., Chan E. D., Adjemian J., Dunn R.R., Fierer N. Ecological Analyses of Mycobacteria in Showerhead Biofilms and Their Relevance to Human Health. mBio. 2018; 9 (5): e01614–e01618.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Park S. C., Kang M. J., Han C. H., Lee S. M., Kim C. J., Lee J. M., Kang Y. A. Prevalence, incidence, and mortality of nontuberculous mycobacterial infection in Korea: a nationwide population-based study // BMC pulmonary medicine. 2019. Vol. 19, no. 1. P. 140.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Park S. C., Kang M. J., Han C. H., Lee S. M, Kim C. J., Lee J. M., Kang Y. A. Prevalence, incidence, and mortality of nontuberculous mycobacterial infection in Korea: a nationwide population-based study. BMC pulmonary medicine. 2019; 19 (1): 140.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Prevots D. R., Marras T. K. Epidemiology of human pulmonary infection with nontuberculous mycobacteria: a review // Clinics in chest medicine. 201. Vol. 36, no. 1. P. 13–34.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Prevots D. R., Marras T. K. Epidemiology of human pulmonary infection with nontuberculous mycobacteria: a review. Clinics in Chest Medicine. 2015; 36 (1): 13–34.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Liao T. L., Lin C. F., Chen Y. M., Liu H. J., Chen D. Y. Risk Factors and Outcomes of Nontuberculous Mycobacterial Disease among Rheumatoid Arthritis Patients : A Case-Control study in a TB Endemic Area // Scientific Reports. 2016. Vol. 11, no. 6. P. 29443.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Liao T. L., Lin C. F., Chen Y. M., Liu H. J., Chen D. Y. Risk Factors and Outcomes of Nontuberculous Mycobacterial Disease among Rheumatoid Arthritis Patients: A Case-Control study in a TB Endemic Area. Scientific Reports. 2016. 11 (6): 29443.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Nishiuchi Y., Iwamoto T., Maruyama F. Infection Sources of a Common Non-tuberculous Mycobacterial Pathogen, Mycobacterium avium Complex // Frontiers in medicine. 2017. Vol. 7, no. 4. P. 27.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Nishiuchi Y., Iwamoto T., Maruyama F. Infection Sources of a Common Non-tuberculous Mycobacterial Pathogen, Mycobacterium avium Complex. Frontiers in Medicine. 2017; 7 (4): 27.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Adjemian J., Olivier K. N., Prevots D. R. Nontuberculous mycobacteria among patients with cystic fibrosis in the United States: screening practices and environmental risk // American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 2014. Vol. 190, P. 581–586.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Adjemian J., Olivier K. N., Prevots D. R. Nontuberculous mycobacteria among patients with cystic fibrosis in the United States: screening practices and environmental risk. American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 2014; 190: 581–586.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Esther C. R. Jr., Henry M. M., Molina P. L., Leigh M. W. Nontuberculous mycobacterial infection in young children with cystic fibrosis // Pediatric Pulmonology. 2005. Vol. 40, no. 1. P. 39–44.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Esther C. R. Jr., Henry M. M., Molina P. L., Leigh M. W. Nontuberculous mycobacterial infection in young children with cystic fibrosis. Pediatric Pulmonology. 2005; 40 (1): 39–44.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Gardner A. I., McClenaghan E., Saint G., McNamara P. S., Brodlie M., Thomas M. F. Epidemiology of Nontuberculous Mycobacteria Infection in Children and Young People With Cystic Fibrosis : Analysis of UK Cystic Fibrosis Registry // Clinical Infectious Diseases. 2019. Vol. 68, no. 5. P. 731–737.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Gardner A. I., McClenaghan E., Saint G., McNamara P. S., Brodlie M., Thomas M. F. Epidemiology of Nontuberculous Mycobacteria Infection in Children and Young People With Cystic Fibrosis: Analysis of UK Cystic Fibrosis Registry. Clinical Infectious Diseases. 2019; 68 (5): 731–737.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Levy I., Grisaru-Soen G., Lerner-Geva L., Kerem E., Blau H., Bentur L., Aviram M., Rivlin J., Picard E., Lavy A., Yahav Y., Rahav G. Multicenter cross-sectional study of nontuberculous mycobacterial infections among cystic fibrosis patients, Israel // Emerging Infectious Diseases. 2008. Vol. 14. P. 378–384.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Levy I., Grisaru-Soen G., Lerner-Geva L., Kerem E., Blau H., Bentur L., Aviram M., Rivlin J., Picard E., Lavy A., Yahav Y., Rahav G. Multicenter cross-sectional study of nontuberculous mycobacterial infections among cystic fibrosis patients, Israel. Emerging Infectious Diseases. 2008; 14: 378–384.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Olivier K. N., Weber D. J., Wallace R. J., Faiz A. R., Lee J. H., Zhang Y., Brown-Elliot B. A., Handler A., Wilson R. W., Schechter M. S., Edwards L. J., Chakraborti S., Knowles M. R. Nontuberculous mycobacteria. I: multicenter prevalence study in cystic fibrosis // American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 2003. Vol. 167, no. 6. P. 828–834.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Olivier K. N., Weber D. J., Wallace R. J., Faiz A. R., Lee J. H., Zhang Y., Brown-Elliot B. A., Handler A., Wilson R. W., Schechter M. S., Edwards L. J., Chakraborti S., Knowles M. R. Nontuberculous mycobacteria. I: multicenter prevalence study in cystic fibrosis. American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 2003; 167 (6): 828–834.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Sermet-Gaudelus I., Le Bourgeois M., Pierre-Audigier C., Offredo C., Guillemot D., Halley S., Akoua-Koffi C., Vincent V., Sivadon-Tardy V., Ferroni A., Berche P., Scheinmann P., Lenoir G., Gaillard J. L. Mycobacterium abscessus and children with cystic fibrosis // Emerging Infectious Diseases. 2003. Vol. 9, no. 12. P. 1587–1591.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Sermet-Gaudelus I., Bourgeois M. Le., Pierre-Audigier C., Offredo C., Guillemot D., Halley S., Akoua-Koffi C., Vincent V., Sivadon-Tardy V., Ferroni A., Berche P., Scheinmann P., Lenoir G., Gaillard J. L. Mycobacterium abscessus and children with cystic fibrosis. Emerging Infectious Diseases. 2003; 9 (12): 1587–1591.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Lee M. R., Sheng W. H., Hung C. C., Yu C. J., Lee L. N., Hsueh P. R. Mycobacterium abscessus Complex Infections in Humans // Emerging Infectious Diseases. 2015. Vol. 21, no. 9. P. 1638–1646.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Lee M. R., Sheng W. H., Hung C. C., Yu C. J., Lee L. N., Hsueh P. R. Mycobacterium abscessus Complex Infections in Humans. Emerging Infectious Diseases. 2015; 21 (9): 1638–1646.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">de Koff E. M., de Groot K. M., Bogaert D. Development of the respiratory tract microbiota in cystic fibrosis // Current Opinion in Pulmonary Medicine. 2016. Vol. 22, no. 6. P. 623–628.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">de Koff E. M., de Groot K. M., Bogaert D. Development of the respiratory tract microbiota in cystic fibrosis. Current Opinion in Pulmonary Medicine. 2016; 22 (6): 623–628.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Françoise A., Héry-Arnaud G. The Microbiome in Cystic Fibrosis Pulmonary Disease // Genes (Basel). 2020. Vol. 11, no. 5. P. 536.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Françoise A., Héry-Arnaud G. The Microbiome in Cystic Fibrosis Pulmonary Disease. Genes (Basel). 2020; 11 (5): 536.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit19"><label>19</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Leung J. M, Olivier K. N. Nontuberculous mycobacteria : the changing epidemiology and treatment challenges in cystic fibrosis // Current Opinion in Pulmonary Medicine. 2013. Vol. 19, no. 6. P. 662–669.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Leung J. M., Olivier K. N. Nontuberculous mycobacteria: the changing epidemiology and treatment challenges in cystic fibrosis. Current Opinion in Pulmonary Medicine. 2013; 19 (6): 662–669.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit20"><label>20</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Tichenor W. S., Thurlow J., McNulty S., Brown-Elliott B. A., Wallace R. J Jr, Falkinham J. O. 3rd. Nontuberculous Mycobacteria in household plumbing as possible cause of chronic rhinosinusitis // Emerging Infectious Diseases. 2012. Vol. 18, no. 10. P. 1612–1617.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Tichenor W. S., Thurlow J., McNulty S., Brown-Elliott B. A., Wallace R. J. Jr, Falkinham J. O. 3rd. Nontuberculous Mycobacteria in household plumbing as possible cause of chronic rhinosinusitis. Emerging Infectious Diseases. 2012; 18 (10): 1612–1617.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit21"><label>21</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Поликарпова С. В., Жилина С. В., Кондратенко О. В., Лямин А. В., Борзова Ю.В. Руководство по микробиологической диагностике инфекций дыхательных путей у пациентов с муковисцидозом. М.; Тверь : Триада, 2019. 128 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Polikarpova S. V., Zhilina S. V., Kondratenko O. V., Lyamin A. V., Borzova Yu. V. Guidelines for microbiological diagnosis of lungs in patients with cystic fibrosis. Moscow; Tver. Triada; 2019. 128 p. (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
